現在是科研規劃、科研委員會與科研機構、科研人員脫節，沒有形成一種有效的管理與支持機制，而中間的行政性管理又不到位。經費亂報只是冰山一角，有些則隱蔽得多。
山東省2006年度審計報告近日公布，對高校科研經費使用情況的審計發現，直接用于課題研究的費用
開支僅佔四成，而管理費用、人員經費等開支約佔六成。令人匪夷所思的是，一些家庭電器支出、學費、汽車保險費也在科研項目經費中報銷。（新華社7月29日電）
表面上看，這是有關科研人員在利用國家科研項目經費損公肥私、中飽私囊，而真正的原因卻源于有關科研管理、規劃制度的缺陷。事實上，我們對與科研制度有關的學術規范、規劃、責任、權力、財務管理並沒有進行係統的科學研究，尚無可行性的規章制度進行有效管理。
一些重大課題是行政決策的結果，課題一旦公布出來，就會有各家高校或學術機構前來“公關”，一些課題被公關下來之後，經費就一攬子劃撥下去，成果出來後，多由相關研究者組織專家來驗收，對成果延誤或無法完成，並無懲罰性措施。而由于申請得來的科研經費並不由所在單位支出，所在單位按比例收取自己的“管理費”，對其他報銷也就聽其自便了。最後，納稅人就成了冤大頭。
再者，科研項目每年由有關機構專家委員會與相關行政領導利用有限的時間，拍板定案，而對下級申報材料，也難有真正科學合理的審核，這使得科研經費劃撥有很大的隨意性，這也是科研人員虛報亂報科研經費的原因之一。
所以，前期的嚴格審核預算與後期的嚴格審計，是使科研經費合理使用的有力保證。
一些與國家安全無關的項目應該有前期預算公開與後期成果公布、成本公開（可通過網絡），讓這些項目成果與經費支出“曬”在陽光下，有效地擠壓虛報科研經費的腐敗空間。
保證國家科研經費用在科研的刀刃上，就要將科研申報與科研管理作為一項係統管理工程來研究，制定規章制度，建立紅、黑名單制度，對科研成果效率與效益高的機構與專家，要有相應的鼓勵性措施，使他們更多地承擔國家重大課題，而對那些科研經費管理不善的單位個人，在一定時間內限制其申報課題，而多報亂報的經費，應該限期追回。
在目前科研管理制度不很完善的情況下，可採用三級科研管理方式，一是對國家重大課題，要讓有信用、有實力的科研單位負責，課題結題時一次性審計；二是對有一定學術實力的單位與個人，實行分期經費劃撥，對其階段性成果鑒定合格後，再劃撥下一筆經費；三是對社會上未申報科研課題的項目，他們動用個人、單位甚至企業的經費，完成了有價值的科研項目，這些項目也可以申報國家科研經費，國家組織專家對其階段性成果或最終成果進行匿名評審，根據其價值與貢獻，給予經費補給或獎勵，以鼓勵民間與非公科研人員多出成果。
現在是科研規劃、科研委員會與科研機構、科研人員脫節，沒有形成一種有效的管理與支持機制，而中間的行政性管理又不到位，或是懶政，或是缺乏科學管理的素質，致使課題的申報、管理、成果的社會價值都容易出現各種問題。
經費亂報只是冰山一角，是容易被審計發現的一角，那些重復研究、盲目研究、為申報經費而虛報課題的現象，有些則隱蔽得多。要治理科研腐敗，在制度建設上還有許多事情要做。（吳祚來）
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