據臺灣《聯合報》報道，國民黨秘書長吳敦義將在新任黨主席產生後，主動辭去秘書長職務，尊重新任黨主席的人事布局。黨政人士指出，吳敦義在此刻辭黨職拼“立委”，似有維持黨務中立、強攻“立法院”龍頭的意味。
吳敦義表示，新的黨主席產生後，“一定要總辭，讓新黨主席有通盤考慮黨人事的空間，這是應該的。”他說，辭秘書長與參選“立委”無關，之前他曾向代主席江丙坤請假，以便爭取“立委”提名，但江認為吳選區是同額初選，狀況單純，未予準假。
國民黨人士表示，早在吳伯雄、洪秀柱登記參加國民黨主席補選前，吳敦義就有辭職想法，當時吳敦義曾告知部分黨內高層，也透過管道傳達給前主席馬英九。馬英九陣營對此高度重視，幕僚表示，吳敦義辭職將影響黨內生態，必須及早因應。
部分國民黨高層私下證實聽聞吳敦義將辭職的消息。某位高層分析，吳敦義此舉，著眼于“立委”選舉布局，同時也有“更上層樓”的味道；若吳敦義持續坐在秘書長位置上，爭取“立法院長”提名反而綁手綁腳，被批黨務不中。
