醫院於2013年確立了“12345”中長期發展思路,一個理念,二個改善,三個目標,四個提高,五個抓手。一個理念是:人才強院,科技興院;二個改善是:改善職工福利待遇,改善患者就醫環境;三個目標是:一流管理、一流服務、一流技術的“大專科,小綜合”的現代化傳染病專科醫院;四個提高是:提高醫療服務質量,提高科研創新能力,提高公共衞生應急處置能力,提高患者滿意度;五個抓手是:全院職工共同努力全力打造傳染病專科醫院的專科技術品牌特色,在增強醫院核心競爭力上下功夫;爭取項目改善醫院就診環境,把舊的門診病房樓改造成一座與現代化傳染病功能相匹配的綜合性大樓;爭取資金,在增加新醫療設備、加強信息化建設上下功夫;爭取各方支持,在拓展服務領域、增設特色科室、加強科研重點學科建設、加大人才培養上下功夫;加強管理在提高醫療服務質量和技術水平上下功夫。