蒙醫蒙藥有著悠久的歷史，是蒙古族人民長期同疾患作鬥爭的經驗總結，並吸收藏醫、漢醫經驗逐漸形成的。早年蒙古汗國建立前，就有本族的藥劑和療法。蒙古醫學有多種診斷方法和治療方法。蒙藥與中藥相似，以草藥為主，是多種草藥研成藥末制成的。治病多用成藥，並總結出飲食療、炙療、罨療，瑟博素療、皮療、溫泉療、針刺放血療、按摩療等方法。蒙古族醫學家和藥學家還寫出一批醫藥著作，如《飲膳正要》、《方海》、《蒙藥正典》、《蒙醫藥選編》、《普濟雜方》。