李金華說，開發區面臨一些需要研究和解決的問題：

    國家關于開發區的稅收政策面臨的問題。審計調查的6個省（市）開發區，2003年以來共減免稅款183.56億元。此外，各地還普遍存在擴大優惠政策范圍的問題，如擅自擴大開發區面積、違規認定高新技術企業、批準區內注冊區外經營企業享受稅收優惠等，由此導致國家稅款流失66.47億元。

    地方政府關于開發區的財政政策中存在的問題。審計調查的87個開發區中，65個制定了明確的財政返還政策；79個開發區向企業返還120.15億元。這一做法加劇形成的虛收虛支嚴重影響了開發區的財政質量。

    地方政府關于開發區的土地出讓政策中存在的問題。調查發現，為“招商引資”，2003年至2005年6月，87個開發區中有60個違規低價出讓土地7873萬平方米，少收土地出讓金55.65億元。